Game Boy Advance, SP và Micro có nhiều màu sắc và phiên bản giới hạn.

Game Boy Advance

Game Boy Advance mặc định gồm các màu Trắng Arctic, Đen, Cam, Fuchsia (Hồng Tím), Glacier (Xanh / Tím mờ) và Indigo (Chàm). Sau đó các màu bổ sung và phiên bản đặc biệt đã được phát hành. Các phiên bản này bao gồm: Đò, Cam/Đen trong suốt, Bạc, Trắng, Vàng Gold, phiên bản Hello Kitty (màu hồng của Hello Kitty và logo trên viền bezel), phiên bản King of Fighters (màu đen với hình ảnh trên bezel và nút), phiên bản Chobits (màu xanh nhạt mờ, với hình ảnh trên bezel và nút), Battle Network Rockman EXE 2 (màu xanh nhạt với hình ảnh trên bezel), phiên bản Mario Bros. (Glacier với Mario và Luigi trên bezel) và Yumiuri Giant (Glacier với hình ảnh trên bezel).

Một số phiên bản giới hạn của Pokémon cũng được bán trong các cửa hàng Pokémon Center tại Nhật Bản. Các phiên bản này bao gồm: phiên bản Gold Pokémon (Vàng Gold với Pikachu và Pichu trên bezel), phiên bản Suicune (xanh / xám với hình Pikachu và Pichu xám mờ trên bezel, và nhãn dán Pokémon Center ở mặt sau), phiên bản Celebi (màu xanh ô liu với hình Celebi trên bezel) và phiên bản Latias / Latios (hồng / đỏ và tím, với hình của Latias và Latios trên bezel).

Game Boy Advance SP

Game Boy Micro

• Đen (bao gồm mặt nạ bạc, xanh camo và lửa)
• Bạc (bao gồm mặt nạ năng lượng màu đen, hoa và màu xanh)
• Màu xanh lá cây (chỉ có ở châu Âu)
• Màu xanh (chỉ có ở Châu Âu và Nhật Bản)
• Màu hồng (chỉ có ở châu Âu)
• Màu đỏ (chỉ có ở Úc)
• Hoa oải hương (chỉ có ở Nhật Bản)
• Phiên bản kỷ niệm 20 năm của Famicom
• Final Fantasy IV
• Lite Blue (chỉ có ở Nhật Bản)
• Mother 3 (Đỏ)